Брод позднее был назван Крымским. Эпоха расцвета монастыря пришлась на конец XVII века, когда в его стенах разместилось «Учительное братство», объединившее образованнейших монахов той поры «ради учения книжного». «Братство» впоследствии положило начало Славяно-Греко-Латинской академии, став по сути первым высшим образовательным учреждение в России. После секуляризации земель в 1764 году, монастырь был расформирован и преобразован в богадельню. В 1991 году монастырь был возвращен Русской православной церкви.